La guitarra flamenca difiere en su sonido de la guitarra clásica principalmente sonido por una construcción ligeramente distinta y la utilización de otros tipos de maderas (ébano, palosanto, etc...) respecto a la guitarra clásica. La guitarra flamenca tiene un sonido más percusivo y su caja es un poco más estrecha.
La guitarra flamenca tiene menos sonoridad y ofrece menos volumen que una guitarra de concierto, pero su sonido es más brillante, y su ejecución es más fácil y rápida, debido a la menor altura de las cuerdas respecto al diapasón, lo que permite que se pueda hacer menos presión con los dedos de la mano izquierda.
Además debido a la técnica del flamenco, la guitarra flamenca debe llevar debajo del agujero un golpeador o protector (a veces también uno superior), para evitar que los rasgueos y golpes que se dan en la tapa armónica afecten a la madera.